Капитан Джек Воробей снова без корабля и без «Чёрной жемчужины». В Лондоне его ловят и тащат к королю Георгу который хочет чтобы Воробей нашёл Источник вечной молодости раньше испанцев. Джек сбегает и выясняет что по городу кто-то набирает команду от его имени. Самозванцем оказывается Анжелика, бывшая возлюбленная которую он когда-то бросил. Она силой затаскивает его на корабль «Месть Королевы Анны», которым командует её отец, легендарный пират Чёрная Борода. Владеет магией вуду, подчиняет корабль силой мысли, канаты на палубе двигаются сами и хватают непослушных матросов. Над Чёрной Бородой висит пророчество, ему суждено погибнуть от руки одноногого человека. Чтобы обмануть судьбу ему нужна вода из Источника молодости.
Для ритуала с Источником нужны два серебряных кубка и слеза русалки. За кубками охотится Барбосса который теперь служит королевскому флоту, потерял ногу и мечтает отомстить Чёрной Бороде за свой корабль. За русалкой отправляют отряд в Белую бухту где обитают создания красивые как ангелы и смертоносные как акулы. Молодой миссионер Филип влюбляется в пойманную русалку Сирену, Анжелика разрывается между отцом и Джеком, а сам Воробей пытается выкрутиться из ситуации где ему нужно всех обыграть и при этом остаться в живых.